Den City es una ciudad con sistemas de red avanzados en los que SOL Technologies creó un espacio de realidad virtual llamado LINK VRAINS. Los Caballeros de Hanoi, un grupo que piratea los duelos, así como SOL Technologies están buscando un misterioso programa de IA. Yusaku Fujiki, también conocido como Playmaker, es un estudiante de primer año de secundaria que logra capturar este programa de inteligencia artificial mientras intenta descubrir la verdad sobre un incidente en el pasado.