Esta serie ganadora del premio Emmy relata los eventos y las batallas de la última gran guerra de la República Galáctica: las Guerras Clon. El Maestro Jedi Obi-Wan Kenobi lidera un asalto al planeta Muunalist, hogar del Clan Bancario Intergaláctico; su Padawan, Anakin Skywalker, es designado por el Canciller Supremo Palpatine para dirigir las fuerzas espaciales de la República. Mientras tanto, el líder Separatista y Lord Sith, el Conde Dooku, toma a la gladiadora sensible a la Fuerza Asajj Ventress como su aprendiz Sith, y le asigna la tarea de eliminar a Skywalker.