Queriendo dejar su pasado atrás, Kaiba destruye la isla donde se llevó a cabo la final del torneo, logrando Yugi y sus amigos escapar y regresar a casa. Yugi y sus amigos toman caminos distintos, pero Yugi y Joey todavía tienen una última prueba, en la que Joey buscará recuperar su «Dragón Negro de Ojos Rojos» enfrentándose a su amigo.