Después de su victoria sobre Jack en la Copa de la Fortuna, Yusei es nombrado el nuevo Rey del Duelo. Mientras Yanagi informa a la pandilla sobre los Firmantes y las Marcas de nacimiento del dragón, Yusei es desafiado por un hombre misterioso con una marca de nacimiento en forma de araña en el brazo que puede convertir el duelo en un Duelo de sombras. Yusei se sorprende al descubrir que su oponente tiene un nuevo tipo de monstruo temible, un Monstruo de Sincronía Oscura. Mientras tanto, una reportera llamada Carly intenta obtener información sobre el nuevo Duel King.