Juna, una estudiante de secundaria que practica el tiro con arco tradicional japonés, viaja a lo largo de la orilla del mar en la motocicleta de su amiga Tokio cuando sufre un misterioso accidente y ella muere. Mientras su espíritu se aleja flotando, un niño la detiene y le dice que le concederá una segunda vida si lucha para defender la Tierra de los extraños ‘gusanos’ llamados Raaja. También conocemos a la misteriosa organización SEED, que se encuentra en la escena de un desastre que involucra a los Raaja en una planta de energía nuclear.