Han pasado veinte años desde el fracaso del Proyecto Elysion, un proyecto masivo de automatización de la fuerza laboral. Artemis, la inteligencia artificial en el centro del proyecto, había elegido atacar a la humanidad y la Tierra ha sido devastada desde entonces. Una niña llamada Emperatriz se despierta en la base de una instalación de investigación subterránea, habiendo perdido todo recuerdo de su pasado. Conoce a un joven dúo de hermanos y hermanas llamados Norito y Miya, que llegaron a la base para recolectar agua preciosa. Empress pretende llegar a la superficie junto con ellos dos, pero se encuentra cara a cara con muchos enemigos diferentes, y Empress pronto se encuentra acorralada…