La historia comenzó en un salón de clases de una escuela secundaria. Nuestro personaje principal, Kyu, cuando fue llamado por el consejero escolar, declaró que quería ser detective. Tomó el examen de ingreso a la Escuela de Detectives Dan donde se reúnen personas talentosas de todo el país. Aprobó el difícil examen de ingreso para la llamada «clase Q» (Q = calificado), que es instruido personalmente por el fundador y director de la escuela, el legendario y famoso detective Dan Morihiko. Allí conoció a Minami Megumi (Meg) con su habilidad de memoria fotográfica, Touyama Kintarou (Kinta) – el descendiente de «Kin-san» de Touyama, Narusawa Kazuma (Kazuma) – un genio programador, y Amakusa Ryu (Ryu) – el extraño estudiante de Todai (Universidad de Tokio). Los cinco trabajan juntos, además de competir entre sí, encaminándose hacia la graduación.