Yoh Azakuza es un joven «shaman», una persona que puede ver y comunicarse con espíritus. Además los shaman tienen el poder de unirse y usar las habilidades de los espíritus en combate. Yoh está entrenando para volverse el Shaman King, el más fuerte entre todos, un título que se obtiene ganando una competencia que se efectúa cada 500 años.

Cuenta la historia, que cada 500 años se celebra en la tierra un Torneo en el cuál se elige a aquél que será el salvador del periodo de destrucción que asolará la tierra. Dicho salvador es aquel que será nombrado Shaman King, el Rey de los Shamanes. Yoh Asakura, descendiente de una poderosa familia de Shamanes, quiere convertirse en ese salvador.

Para ello, se rodeará de sus amigos para conseguir llegar a la final del Torneo. Sin embargo, poderosos enemigos intentaran lograr el mismo objetivo, y para ello tendrán que luchar entre ellos por el título. Uno de ellos será el máximo enemigo de Yoh durante la aventura, que pretenderá convertirse en el Shaman King por todos los medios necesarios.

Esa persona es Hao Asakura, cuyo único propósito que destruir a la raza humana y crear así un mundo habitado exclusivamente de Shamanes. Pero Yoh no permitirá tal cosa, y para conseguirlo, deberá derrotar a Hao a pesar de ser ni mas ni menos que su hermano gemelo. Comienza así la mayor batalla de la historia, donde quedará decidido el destino del mundo.